除前面提到的研發項目立項、驗收等工作外，企業還應明確相關部門在研發支出加計扣除工作的職責。

1.研發部門的職責

（1）研發小組應登記研究開發項目費用支出臺賬，并與財務部門進行定期對賬。

（2）研發項目的采購申請、材料領用和費用報銷等，應在相關采購申請單、領料單和費用報銷單上注明研發項目名稱或編號。

（3）研發項目涉及試生產安排的，應詳細記錄用工工時或用工工資支出情況，并報人力資源部門和財務部門以便進行單獨核算。

（4）涉及與生產經營部門共用設備、儀器的，應提供使用情況說明及使用工時等。

2.人力資源部門的職責：

（1）按照研發項目小組成員名單向財務部門提供單列的工資匯總表、明細表。

（2）按照研發項目小組成員名單向財務部門提供單列的基本養老保險費、基本醫療保險費、失業保險費、工傷保險費、生育保險費和住房公積金匯總表、明細表。

（3）向財務部門提供專門針對研發項目而發生的未納入工資表的獎金、津貼、補貼等費用明細清單。

（4）有外聘研發人員的，按照研發項目小組的向財務部門提供勞務費用支出及聘用協議副本。

3．財務部門的職責：

（1）做好研發加計扣除后期核查的文件檔案管理工作。

（2）嚴格按照會計準則進行研發支出的會計核算，“專賬”與“輔助賬”相結合，分別歸集各項目的研發費用列支情況。

（3） 編制研發項目費用發生情況歸集表。該表119號文未做要求，但是從企業財務管理角度出發還是有必要的，只是歸集表的格式與內容應該按照119號文進行修改。

（4）在年度終了進行所得稅年度申報和匯算清繳時，按稅法規定計算研發支出的加計扣除金額，并辦理相關申報事宜。

（5）及時收集研發支出加計扣除涉及的資料并整理歸檔：項目前期調研報告、項目可研報告、項目立項申請、項目立項批復、項目計劃書、組織編制文件（責任人、崗位、職責）和專業人員名單、項目費用預算、項目相關的合同或協議、項目費用發生情況歸集表、項目效用情況說明書或研究成果報告、項目專利申請受理書或專利證書、項目版權登記證、項目鑒定意見書、項目科技成果鑒定、項目驗收報告等。

上述資料可能各企業名稱不一致，但是與研發項目相關的資料財務部門一定要專人專門收集并按項目進行歸檔，妥善保管，以備稅務機關的后期核查。