高新技術企業的稅務稽查主要集中在高新收入、知識產權、研發費用和科技人員四個方面。

一、高新技術企業的稅務稽查重點

1、高新收入稽查

（1）真實性審查：核查高新技術產品（服務）收入的核心技術及其應用場景，確保其符合《國家重點支持的高新技術領域》的規定。

（2）收入分類歸集：檢查高新收入是否按照規定進行分類歸集，并確保高新收入占同期總收入的比例達到60%。

2、知識產權稽查

（1）核心支持作用：驗證知識產權是否對企業主要產品（服務）提供了核心技術支持。

（2）獲得時間和歸屬：確認知識產權的合法性和有效性，確保其在申報前已獲得并歸屬于企業。

（3）現場驗證：對于軟件著作權等，可能要求現場運行軟件，以驗證其真實性和實際應用情況。

3、研發費用稽查

（1）專項審計報告：核查企業的研發費用明細賬，確保支出的真實性和合理性。

（2）占比要求：核查研發費用占銷售收入的比例是否符合規定的標準。

（3）歸集分類：審查研發費用的發生額和歸集分類的真實性和準確性。

4、科技人員稽查

（1）人員真實性：通過勞動合同、社保繳納信息、個稅申報信息等確認科技人員的真實性。

（2）在職天數：確保科技人員的累計工作時間符合高新技術企業認定要求。

二、高企資格被取消風險 

高新技術企業在享受國家稅收政策優惠的同時,也面臨著因不符合高企認定條件等方面,面臨高企資格被取消的風險甚至引發稅務風險,以下是常見情形:

1、高新收入不實：高新技術產品（服務）收入申報不實。

2、研發弄虛作假：在研發費用、研發人員等方面弄虛作假。

3、知識產權作假：申請認定材料中存在知識產權虛假情況。

4、比例條件不達標：研發費用及科技人員比例不再符合認定要求。

5、未履行年報義務：連續兩年未填報高新技術企業年報。

6、條件變更未報告：企業發生更名、合并、重組等重大變化未及時報告。

7、重大違規事故：發生重大安全、質量事故或嚴重環境違法行為。