在高新技術企業認定中，委托開發、合作開發等不同的開發方式在申請研發費用加計扣除有以下兩個方面的規定：

一、委托開發

《財政部國家稅務總局關于完善研究開發費用稅前加計扣除政策的通知》（財稅〔2015〕119號）*二條*1款規定，企業委托外部機構或個人進行研發活動所發生的費用，按照費用實際發生額的80%計入委托方研發費用并計算加計扣除，受托方不得再進行加計扣除。委托外部研究開發費用實際發生額應按照獨立交易原則確定。

委托方與受托方存在關聯關系的，受托方應向委托方提供研發項目費用支出明細情況。

企業委托境外機構或個人進行研發活動所發生的費用，不得加計扣除。

《國家稅務總局關于企業研究開發費用稅前加計扣除政策有關問題的公告》（國家稅務總局公告2015年*97號）*三條規定，企業委托外部機構或個人開展研發活動發生的費用，可按規定稅前扣除；加計扣除時按照研發活動發生費用的80%作為加計扣除基數。委托個人研發的，應憑個人出具的發票等合法有效憑證在稅前加計扣除。

企業委托境外研發所發生的費用不得加計扣除，其中受托研發的境外機構是指依照外國和地區（含港澳臺）法律成立的企業和其他取得收入的組織。受托研發的境外個人是指外籍（含港澳臺）個人。

委托方與受托方存在關聯關系的，受托方應向委托方提供研發項目費用支出明細情況。

企業委托境外機構或個人進行研發活動所發生的費用，不得加計扣除。

二、合作開發

《財政部國家稅務總局關于完善研究開發費用稅前加計扣除政策的通知》（財稅〔2015〕119號）*二條*2款規定，企業共同合作開發的項目，由合作各方就自身實際承擔的研發費用分別計算加計扣除。